miRNA発現解析-GeneChip
特徴
Thermo Fisher Scientific社のマイクロアレイを用いたSmall RNAの発現解析です。
GeneChip miRNA Array は1アレイで多数の生物種を調べることができ、包括的にSmall RNAをカバーしています。
ヒト、マウス、ラット、イヌ、サルなど、研究および医薬品開発に重要な203種類の生物種を解析することが可能です。
ヒトの核小体低分子RNA(snoRNAおよびscaRNA)も含んでいます。
サービス概要
- サンプルのクオリティチェック(QC)を行います。
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スキャナーにより蛍光の検出を行い蛍光強度を数値化して
miRNA発現解析を行います。
データ解析
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1.生データ
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2.正規化
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3.発現変動miRNAの抽出
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4.miRNAの標的遺伝子予測
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5.予測された
標的遺伝子
GO解析 -
6.予測された
標的遺伝子の
Pathway解析
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5.予測された
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4.miRNAの標的遺伝子予測
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3.発現変動miRNAの抽出
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2.正規化
発現変動のみられるmiRNAをFold Change比較やT検定、クラスター解析などにより抽出します。
さらに、miRNAが標的とする遺伝子をTargetScanにより予測します。
ターゲットスキャン
miRNAの標的遺伝子の予測プログラムです。
既知のmiRNA-mRNA結合モデルを元に、他のmiRNAがターゲットとする遺伝子の予測を行います。
miRNA解析と遺伝子発現解析を同時にご依頼いただいている場合には、 ターゲットスキャンにより
miRNAデータと遺伝子発現データを連結して、解析を行うこともできます。
納品物
- Sample QC report(品質検査結果)
- Raw Data(数値データ)
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解析結果
※ クラウド経由での納品または記録媒体(CD/DVD)
納期
サンプルQC通過後、2か月程度(データ解析を含む場合は2.5か月程度)
サンプルについて
RNA 量 | 濃度 | OD260/280 | 性状 | |
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total RNA | 1000ng以上 | 125ng/μL以上 | 1.8〜2.1 | RIN値:7.0以上 |
- サンプル量が上記に満たない場合はお気軽にご相談ください。
- 組織、細胞等は、DNA/RNA抽出をご確認いただくか別途お問い合わせください。
- 送付方法はサンプル送付方法をご確認ください。
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