SNPジェノタイピング-illumina
特徴
illumina社のマイクロアレイを用いたDNAのSNP解析です。
イルミナのInfiniumアッセイと強固なBeadChipアレイを組み合わせることで、高精度のデータ品質、
優れたコールレート、高密度のゲノムカバレッジと高い再現性を有しています。
コスト効率良く全ゲノムジェノタイピングを実施されたい方に
低コストかつ高品質のデータを提供します。
オプション解析として、小家系連鎖解析および全ゲノム関連解析（GWAS）のご提供します。
サービス概要
送付して頂いたDNAサンプルのクオリティチェック（QC）後、ジェノタイピングアレイのInfiniumアッセイ・スキャンニングまで実施いたします。これらの作業は、CLIA/CAP認定を受けた弊社提携先のラボにて実施されます。
コスト効率の高いAsian Screening Arrayや全ゲノム関連解析（GWAS）に比類ないパワーを発揮するOmniマイクロアレイなど、目的に合わせてお選びいただけます。
Human Array
| チップ名 | 特徴 |
|---|---|
| Infinium Global Screening Array |
集団規模の遺伝子研究向け 変異スクリーニング、及び個別化医療研究などのクリニカルリサーチ向け |
| Infinium Asian Screening Array | アジア特異的な低頻度の疾患関連SNP, PGx, HLAコンテンツをカバー |
| 【Omniシリーズ】 Infinium Omni5 Infinium Omni2.5 Infinium OmniExpressExome Infinium OmniExpress |
ジェノタイピング、GWAS、及びCNV解析のための包括的なカバレッジと機能領域のエクソンコンテンツ |
| Infinium Core | 高スループット |
| Infinium Exome | ヒトのエクソン領域にフォーカス |
Animal Array
| チップ名 | 特徴 |
|---|---|
| BovineHD | ウシ高密度SNP解析用・約78万マーカー搭載 |
| BovineSNP50 | ウシSNP解析用・約5.4万マーカー搭載 |
| BovineLD | ウシ低密度SNP解析用・約8千マーカー搭載 |
| PorcineSNP60 | ブタSNP解析用・約6.4万マーカー搭載 |
| CanineHD | イヌ高密度SNP解析用・約17万マーカー搭載 |
※その他チップをご希望の場合は別途お問い合わせください。
データ解析
GenomeStudioデータ作成を行います。
各種ストランドでジェノタイプデータを出力を行います。
納品物
- 解析報告書
- RAWデータ
- ジェノタイプデータ
- アノテーションデータ
- GenomeStudioデータ
- GenomeStudioデータ作成に必要なファイル一式
※連鎖解析実施時は、候補領域リストおよび候補領域図も納品します。
納期
サンプルのクオリティチェック（QC）通過後、1.5-2か月程度。
サンプルについて
| マイクロアレイフォーマット | ゲノムDNA量 | サンプル濃度(ng/μL) |
|---|---|---|
| Genotyping Array | 1500ng以上 | 50ng/μL以上 |
- サンプル量が上記に満たない場合はお気軽にご相談ください。
- チップによってはサンプル条件が異なる場合がありますのでお問い合わせください。
- 組織、細胞等は、DNA/RNA抽出をご確認いただくか別途お問い合わせください。
- 送付方法はサンプル送付方法をご確認ください。
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お問い合わせ
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