DNAメチル化解析-メチル化パネル解析
（QIAGEN QIAseq Targeted Methyl Panels）受託サービス

DNAメチル化解析

DNAメチル化解析は次世代シーケンスにおける主要なアプリケーションのひとつです。DNAのメチル化（シトシン5位のメチル化）は、哺乳類などにおいて遺伝子発現調節に深く関わる機構であり、ヒストン修飾と並んでエピジェネティクスという大きな研究分野となっています。

Breast Cancer (89遺伝子)、Colorectal Cancer (63遺伝子)、Immuno Oncology (68遺伝子) のパネルをご用意。カスタムパネル作製も可能
FFPEサンプルや循環セルフリー DNA（ccfDNA）にも対応
微量サンプル (10 ng～) でも測定可能
分子バーコードによる正確なメチル化解析
illumina社の次世代シーケンサー (MiSeq) によるシーケンス
QIAGEN Gene Globe Data Analysis Center (データ解析クラウド) が無償で利用できます (ユーザー登録が必要)

QIAseq Targeted Methyl Human Breast Cancer Panel
ヒト肺がんに関連した89遺伝子におけるメチル化を解析
QIAseq Targeted Methyl Human Colorectal Cancer Panel
ヒト大腸がんに関連した63遺伝子におけるメチル化を解析
QIAseq Targeted Methyl Immuno-Oncology Panel
がん免疫に関連した68遺伝子におけるメチル化を解析

1.サンプルのクオリティチェック (QC)

2.DNAバイサルファイト変換

3.ターゲット領域増幅＆ライブラリー調製

4.シーケンス

5. データ解析 (オプション)

サンプルのクオリティチェック（QC）を行います。
DNAのバイサルファイト変換を行います。バイサルファイト変換により、非メチル化シトシンはウラシル (PCR後チミン) に変換されますが、メチル化シトシンは変換されないため、メチル化を配列上の違いとして検出可能になります。

バイサルファイト変換試薬
EpiTect Fast Bisulfite Conversion Kits (QIAGEN社)
ターゲット領域の増幅とシーケンスライブラリーの調製を行います。

ライブラリー調整試薬
QIAseq Targeted Methyl Panel（QIAGEN社）
illumina社の次世代シーケンサー(MiSeq) によるシーケンス解析を行います。
リファレンスゲノムへのアライメント（マッピング）と分子バーコード処理、メチル化率の算出を行います。

※ USBメモリ等の記憶媒体もしくはクラウド経由で納品します。
※アライメントデータ (bamファイル) はクラウドでの解析上付属しません。

DNAの種類	ゲノム DNA量	濃度	OD260 /280	OD260 /230	性状	液量
組織・細胞由来 DNA	2ng	0.2ng/μL 以上	1.5 以上	1.0 以上	分解やRNAのコンタミがないこと	10μL 以上
FFPE由来 DNA・ ccfDNA	20ng	2ng/μL 以上	1.5 以上	1.0 以上	RNAのコンタミがないこと	10μL 以上