受託サービス

miRNA解析

解析概要

Feature Extractionで得られたマイクロアレイのデータを解析ソフトウェアGeneSpring GXで解析いたします。

発現変動のみられるmiRNAをFold Change比較やT検定、クラスター解析などにより抽出します。
さらに、miRNAが標的とする遺伝子をTargetScanにより予測します。

ターゲットスキャン

miRNAの標的遺伝子の予測プログラムです。


GeneSpring GXのターゲットスキャンツールで、既知のmiRNA-mRNA結合モデルを元に、 他のmiRNAがターゲットとする遺伝子の予測を行います。


納品物には、ターゲットスキャンの結果が含まれます。








また、miRNA解析と遺伝子発現解析を同時にご依頼いただいている場合、 ターゲットスキャンによりmiRNAデータと遺伝子発現データを連結して、納品いたします。










TargetScanにつきましては下記URLをご参照ください。
TargetScan(http://www.targetscan.org/)

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