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アジレント社製マイクロアレイ 遺伝子発現解析 -微量サンプル-標準原核生物

実験概要

ターゲットの調整はNuGEN Technologies社のRibo-SPIA® 増幅技術を採用しています。まず始めにTotal RNAをテンプレートとし、ランダムプライマーおよびpolyTプライマーを用いて、逆転写反応によりcDNAを合成します。合成したcDNAを基に2本鎖のcDNAを合成した後、リニアにアンチセンスcDNA を合成します。

合成したcDNAをCyanine3またはCyanine5によりラベル化する際には、アジレント社のGenomic DNA Enzymatic Labeling Kitを採用しております。

ラベル化cDNAは、マイクロアレイに1色法または2色法の手法でハイブリダイゼーションし、 蛍光を検出します。

対応生物種

Original
Whole Human GenomeWhole Mouse GenomeWhole Rat Genomeその他
※Gene ListとAnnotationはアジレントテクノロジー社サイトにてご確認ください。
アジレントテクノロジー社サイト
Custom
カスタムお手持ちの配列や公共データベースの配列から、研究目的に沿ったマイクロアレイを作成いたします。
カスタムマイクロアレイ作製サービス
原核生物原核生物については、原核生物の遺伝子発現解析をご参照ください。
原核生物の遺伝子発現解析

納期・納品物

納期

納品時期はサービス内容により異なりますが、目安として以下のスケジュールとなります。

実験
サンプルクオリティチェックが終了してから通常約3週間後に納品いたします。
※相乗りサービスは別途お問合せください。
解析
解析の手法により納期が異なります。別途お問合せください。
実験+解析
実験と統計解析を合わせてご依頼いただく場合、サンプルクオリティチェックが終了してから通常約4週間後に納品いたします。
※ 「その他オプション」をお申込みいただいている場合は、上記日数にオプションの作業日数が加わります。
※ 解析の手法により納期が異なります。
※相乗りサービスは別途お問合せください。

納品物

実験結果(CD-ROMまたはDVD)
解説書PDF
サンプル品質検定結果EXCEL、JPG
マイクロアレイ読み取り結果(生データ)JPG、PDF、TEXT、
正規化データ*EXCEL

*生データのみのご依頼の場合、正規化データは含まれません。

サンプルについて

total RNA量濃度OD260/OD280OD260/OD230性状
500pg以上60pg/μL以上1.5以上1.028s/18s : 1.8以上
RIN値 : 7以上

  • サンプルはNuclease Free Waterに溶解し、冷凍状態でご送付ください。TEバッファなどのEDTAを含むバッファに溶解した場合、データが取得できない可能性があります。
  • サンプルは必ず十分なドライアイスを同梱し、冷凍便で凍結状態でお送りください。
  • 分解が進んだRNAでは、正確なデータが得られない可能性があるため、事前に分解がないこと を確認していただく必要があります。(泳動写真を添付してください)
  • サンプル量が上記に満たない場合、必ず予めご相談ください。
  • 原核生物サンプルについては、原核生物の遺伝子発現解析をご参照ください。
  • *1 total RNAの濃度が200pg/μL以下のサンプルではtotal RNAの品質確認を行うことができないため、リニア増幅およびラベル化後に品質確認を行うことになります。

サンプル送付についての詳細は、TotalRNA サンプルの送り方および下記「マイクロアレイ実験解析受託サービス依頼書」ダウンロードファイルに含まれている「サンプル送付要件.pdf」をご参照ください。

基礎データ

微量でも優れた再現性 ~最低totalRNA 500pg. 卵子1個から解析可能~

【リアルタイムPCRによる増幅前と増幅後のコピー数の比較】

【再現性】

同一のtotal RNA サンプル500pg(sample1)を3回に分けてリニア増幅しリアルタイムPCRで4遺伝子のコピー数を比較しました。各遺伝子のコピー数比を保ったまま、増幅できていることが確認できます。
さらに異なるマイクロアレイにハイブリダイゼーションしたところ、相関係数は0.99であり、再現性のよい結果が得られることを確認しております。同様の方法で、マウスの卵子1個を用いた場合も優れた再現性が得られることを確認しております。

受託サービスご依頼方法

サービスのお申込みは、お電話・E-mailにて承っております。

お申し込み後、受託サービス依頼書をダウンロードいただき必要事項をご記入のうえ、依頼書に記入された弊社E-mailアドレス宛に添付してご送付ください。

※サービスのお申込みに際しましては、弊社の個人情報取り扱いについてご一読いただき、ご同意の上お申込みください。

個人情報の取扱いについて

お問合せ・ご相談・お申込み先

TEL:03-5777-1688
FAX:03-5777-1689
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技術サポートセンター(平日9:30~17:30)
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