1. NGS個別メニュー
2. アンプリコン（PCR増幅産物）シーケンス
3. WGS（全ゲノムシーケンス）
4. WGBS（全ゲノムバイサルファイトシーケンス）
5. ChIP-seq（クロマチン免疫沈降シーケンス）
6. レパトア解析

次世代シーケンス解析の各工程を個別にご提供しております。
それぞれ組み合わせて頂くこともできます。

• 各種サンプルのクオリティチェック（QC）
• FFPE由来ゲノムDNAのQC（qPCR）
• シーケンスライブラリー調製
• シーケンスライブラリーのクオリティチェック
• シーケンス
• データ解析

お客様が調製されたシーケンスライブラリーをお預かりし、ライブラリーのクオリティチェック（QC）から解析までを希望される場合

シーケンスライブラリー調製を希望される場合

FFPEから抽出したgenome DNAの分解度合いをチェックするqPCRによるQCを希望される場合

特定の領域をPCRで増幅したPCR産物をお預かりします。
illuminaの次世代シーケンサーを用いて、PCR増幅産物をシーケンスして解析します。

1. PCR産物のクオリティチェック（QC）を行います。PCR産物のサイズは200bp～300bp程度を推奨しております。
2. PCR産物の両端にシーケンスアダプター付加したシーケンスライブラリーを作製します。
3. 調製したシーケンスライブラリーはQC後、illumina社の次世代シーケンサー(Miseqなど)でシーケンスします。
4. アンプリコンの全長の配列を集計します。リファレンスゲノムへのアライメント（マッピング）なども可能です。

illuminaの次世代シーケンサー（NovaSeq 6000)を用いて、解析対象サンプルのWGS （全ゲノムシーケンス）を行います。全ゲノムを対象とした変異検出解析が可能です。

1. サンプルのクオリティチェック（QC）を行います。
2. サンプル gDNAより、PCRフリーでシーケンスライブラリーを調製します。
3. 調製したシーケンスライブラリーは、illumina社の次世代シーケンサー(NovaSeq 6000など)でシーケンスします。
4. シーケンス後のデータは、リファレンスゲノムにアライメント（マッピング）し、一塩基置換や短い挿入欠失部位を検出します。

illuminaの次世代シーケンサー（NovaSeq 6000)を用いて、全ゲノムを解析対象としたゲノムワイドなメチル化解析、WGBS（全ゲノムバイサルファイトシーケンス）を行います。全ゲノムを対象とした、1塩基単位のメチル化率の算出が可能です。

1. サンプルのクオリティチェック（QC）を行います。
2. バイサルファイト処理後にシーケンスライブラリーを調製します。
3. 調製したシーケンスライブラリーは、illumina社の次世代シーケンサー(NovaSeq 6000など)でシーケンスします。
4. バイサルファイトを考慮したリファレンスゲノムへのアライメント（マッピング）し、CpGごとにメチル化率算出を行います。

クロマチン免疫沈降（ChIP）後のサンプルをお預かりします。
illuminaの次世代シーケンサー（NextSeq500など)を用いて、転写因子やその他のタンパク質が相互作用するDNAの特定部位を検出します。

1. クロマチン免疫沈降 (ChIP) サンプルのクオリティチェック（QC）を行います。
2. シーケンスライブラリーを調製します。
3. 調製したシーケンスライブラリーは、illumina社の次世代シーケンサーでシーケンスします。
4. リファレンスゲノムにアライメント（マッピング）し、ピーク（相互作用部位）を検出し、サンプル間の比較を行います。

サンプルQC通過後、2か月程度
(データ解析を含む場合は2.5か月程度)

クロマチン免疫沈降 (ChIP) 後のサンプルをご用意ください。
送付方法はサンプルの送り方をご確認ください。

illuminaの次世代シーケンサー(MiSeqなど）を用いて、 T/B細胞受容体（TCR/BCR）の多様性（レパトア）解析を行います。

1. サンプルのクオリティチェック（QC）を行います。
2. シーケンスライブラリーを調製します。
3. 調製したシーケンスライブラリーは、illumina社の次世代シーケンサー(MiSeqなど）でシーケンスします。
4. レパトアの多様性を解析します。